Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Lin28aQ8K3Y3 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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