Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms