Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Fbxo48Q8CAT8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms