Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Atg4aQ8C9S8 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Atg4aQ8C9S8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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