Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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FarsaQ8C0C7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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FarsaQ8C0C7 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
FarsaQ8C0C7 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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