Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Focad-202ENSMUST00000107147 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Tnrc6bQ8BKI2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Olfr160-202ENSMUST00000211952 3492 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tnrc6bQ8BKI2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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