Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm16478-201ENSMUST00000208113 5084 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tspan9Q8BJU2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms