Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Dsg1bQ7TSF1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Dsg1bQ7TSF1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms