Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

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Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm15196-201ENSMUST00000121406 482 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Snrnp40Q6PE01 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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