Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Chd4Q6PDQ2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms