Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

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Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Dtx4Q6PDK8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Dtx4Q6PDK8 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dtx4Q6PDK8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dtx4Q6PDK8 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Dtx4Q6PDK8 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dtx4Q6PDK8 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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