Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trak1Q6PD31 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms