Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clcn1Q64347 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms