Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Tfe3Q64092 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tfe3Q64092 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Tfe3Q64092 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tfe3Q64092 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms