Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Defa17Q64016 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Defa17Q64016 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms