Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim28Q62318 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Trim28Q62318 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms