Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Taf6Q62311 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Taf6Q62311 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Taf6Q62311 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms