Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Trim58Q5NCC9 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim58Q5NCC9 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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