Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Rtl5Q5DTT4 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rtl5Q5DTT4 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rtl5Q5DTT4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Rtl5Q5DTT4 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rtl5Q5DTT4 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms