Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm9517-201ENSMUST00000195021 874 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm30709-202ENSMUST00000222476 956 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Samd5Q3V1H9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms