Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm11817-201ENSMUST00000155578 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 G930045G22Rik-202ENSMUST00000161723 673 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps151-201ENSMUST00000176956 982 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 1700020M21Rik-201ENSMUST00000188320 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Spcs2-206ENSMUST00000208465 736 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrc43Q3V0L5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms