Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Rassf9-202ENSMUST00000219445 5294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Mlxipl-201ENSMUST00000005507 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hddc2Q3SXD3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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