Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Cntnap5bQ0V8T8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cntnap5bQ0V8T8 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms