Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Hdac9-206ENSMUST00000209990 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
AmbpQ07456 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms