Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Msx2Q03358 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms