Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
NfiaQ02780 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms