Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
GscQ02591 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Sh3bgrl2-203ENSMUST00000188030 2549 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
GscQ02591 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.27□□□□□ -0.44
GscQ02591 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GscQ02591 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GscQ02591 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GscQ02591 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
GscQ02591 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
GscQ02591 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms