Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Mc1rQ01727 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Mc1rQ01727 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms