Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Top2aQ01320 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top2aQ01320 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms