Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gjb2Q00977 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms