Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rps3aP97351 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Rps3aP97351 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms