Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Rps29P62274 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms