Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp25P57080 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp25P57080 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms