Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Apol11b-201ENSMUST00000166623 2057 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Cwc22-203ENSMUST00000111819 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm39459-201ENSMUST00000215662 1895 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Phf21a-208ENSMUST00000111294 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm3138-201ENSMUST00000165431 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Adamtsl1-209ENSMUST00000141889 7805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Snx32-201ENSMUST00000070172 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Ahcyl2-203ENSMUST00000115238 5129 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Olfr52-202ENSMUST00000215138 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Fgd3-202ENSMUST00000110086 2628 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Tex11-202ENSMUST00000113716 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Ptpn5-202ENSMUST00000102626 3137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Pcx-204ENSMUST00000224726 4034 ntAPPRIS P3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Syt2-201ENSMUST00000121990 6879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Ccdc187-203ENSMUST00000227200 9528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Best3-201ENSMUST00000020378 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Mbd5-203ENSMUST00000112754 5978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Ddx24-206ENSMUST00000221211 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Dock9-206ENSMUST00000212181 7368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Atg13-201ENSMUST00000028678 3604 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Zfp469-202ENSMUST00000187142 3082 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 A430072C10Rik-201ENSMUST00000197848 2532 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Olfr1410-202ENSMUST00000216553 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Atp5eP56382 Nup214-201ENSMUST00000065398 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms