Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cxcl5P50228 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms