Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrprbP47758 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms