Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TfamP40630 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TfamP40630 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TfamP40630 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms