Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PpargP37238 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PpargP37238 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PpargP37238 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PpargP37238 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms