Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sftpa1P35242 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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