Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cd28P31041 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cd28P31041 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Cd28P31041 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cd28P31041 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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