Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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Hoxd10P28359 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Hoxd10P28359 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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