Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Defa5P28312 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
Defa5P28312 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa5P28312 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa5P28312 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa5P28312 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa5P28312 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC8.77□□□□□ -1
Defa5P28312 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Defa5P28312 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Svil-203ENSMUST00000126977 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Defa5P28312 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms