Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
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Hoxd8P23463 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd8P23463 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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