Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hoxb9P20615 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms