Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
PrkcaP20444 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PrkcaP20444 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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