Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 A630023A22Rik-201ENSMUST00000178958 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Hoxb1P17919 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms