Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
H2-Eb1P04230 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms