Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl20O89093 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Ccl20O89093 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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