Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ptbp3-202ENSMUST00000102883 3409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Bloc1s6-201ENSMUST00000005954 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Wdr24-201ENSMUST00000026833 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ptpn20O55082 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms