Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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BckdkO55028 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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BckdkO55028 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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BckdkO55028 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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BckdkO55028 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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BckdkO55028 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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BckdkO55028 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
BckdkO55028 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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